Ogłoszenie o wyniku postępowania
Dostawy
Zakup systemu do sekwencjonowania wielkoskalowego

SEKCJA I - ZAMAWIAJĄCY

1.1.) Rola zamawiającego

Postępowanie prowadzone jest samodzielnie przez zamawiającego

1.2.) Nazwa zamawiającego: Uniwersytet Przyrodniczo-Humanistyczny w Siedlcach

1.4) Krajowy Numer Identyfikacyjny: REGON 000001471

1.5) Adres zamawiającego

1.5.1.) Ulica: Konarskiego 2

1.5.2.) Miejscowość: Siedlce

1.5.3.) Kod pocztowy: 08-110

1.5.4.) Województwo: mazowieckie

1.5.5.) Kraj: Polska

1.5.6.) Lokalizacja NUTS 3: PL925 - Siedlecki

1.5.7.) Numer telefonu: 25 643 1935

1.5.9.) Adres poczty elektronicznej: monika.wachnikowska@uph.edu.pl

1.5.10.) Adres strony internetowej zamawiającego: www.uph.edu.pl

1.6.) Adres strony internetowej prowadzonego postępowania:

https://uph-edu.logintrade.net/.

1.7.) Rodzaj zamawiającego: Zamawiający publiczny - jednostka sektora finansów publicznych - uczelnia publiczna

1.8.) Przedmiot działalności zamawiającego: Edukacja

SEKCJA II – INFORMACJE PODSTAWOWE

2.1.) Ogłoszenie dotyczy:

Zamówienia publicznego

2.2.) Ogłoszenie dotyczy usług społecznych i innych szczególnych usług: Nie

2.3.) Nazwa zamówienia albo umowy ramowej:

Zakup systemu do sekwencjonowania wielkoskalowego

2.4.) Identyfikator postępowania: ocds-148610-a29694e4-1471-11ec-b885-f28f91688073

2.5.) Numer ogłoszenia: 2021/BZP 00237651

2.6.) Wersja ogłoszenia: 01

2.7.) Data ogłoszenia: 2021-10-19

2.8.) Zamówienie albo umowa ramowa zostały ujęte w planie postępowań: Tak

2.9.) Numer planu postępowań w BZP: 2021/BZP 00123227/06/P

2.10.) Identyfikator pozycji planu postępowań:

1.2.10 Dostawa Systemu do sekwencjnowania wielkoskalowego z doposażeniem - aparat główny /sekwenator.

2.11.) Czy zamówienie albo umowa ramowa dotyczy projektu lub programu współfinansowanego ze środków Unii Europejskiej: Nie

2.13.) Zamówienie/umowa ramowa było poprzedzone ogłoszeniem o zamówieniu/ogłoszeniem o zamiarze zawarcia umowy: Tak

2.14.) Numer ogłoszenia: 2021/BZP 00178703/01

SEKCJA III – TRYB UDZIELENIA ZAMÓWIENIA LUB ZAWARCIA UMOWY RAMOWEJ

3.1.) Tryb udzielenia zamówienia wraz z podstawą prawną Zamówienie udzielane jest w trybie podstawowym na podstawie: art. 275 pkt 1 ustawy

SEKCJA IV – PRZEDMIOT ZAMÓWIENIA

4.1.) Numer referencyjny: DZPZ.290.47.2021

4.2.) Zamawiający udziela zamówienia w częściach, z których każda stanowi przedmiot odrębnego postępowania: Nie

4.3.) Wartość zamówienia: 873785,87 PLN

4.4.) Rodzaj zamówienia: Dostawy

4.5.1.) Krótki opis przedmiotu zamówienia

 Moduł do sekwencjonowania
Półprzewodnikowy analizator stołowy nowej generacji o dużej pojemności, nowy, nie rege-nerowany, wyprodukowany w 2021 roku

1. liczba odczytów DNA w jednym kierunku:
możliwość zsekwencjonowania nie mniej niż 260 M odczytów w jeden dzień - sekwencjo-nowanie co najmniej 6 próbek dla egzomów, 14 próbek dla ludzkiego transkryptomu kodującego w ciągu jednego dnia

2. Możliwość pracy z różnym materiałem:
DNA, RNA, miRNA - wyizolowane z krwi, osocza, tkanek, FFPE, wymazów,
cfDNA z płynnych biopsji

3. ilość materiału wejściowego:
do wszystkich zastosowań minimum od 1 ng ( dla cfDNA / FFPE)

4. średni czas sekwencjonowania i analizy danych:
od 4,5 godziny dla ukierunkowanego sekwencjonowania do 12 godzin dla aplikacji egzomu lub transkryptomu (w zależności od aplikacji)

5. Przepustowość:
możliwość zmiany przepustowości w jednym cyklu pracy poprzez zastosowanie różnej po-jemności nośników- minimum 4 (tzn możliwość pracy w 4 różnych trybach przepustowości) , bez użycia optyki .
(podać wielkość i przepustowości).

6. Technologia:
System pracujący bez pomiaru fluorescencji, bez użycia optyki w oparciu o półprzewodnikową technologię pomiaru zmiany pH po wbudowaniu nukleotydu na matrycy DNA w każdym z po-nad miliona naczyń reakcyjnych obecnych na chipie (nośniku) bez konieczności stosowania nie-bezpiecznych chemikaliów i odczynników fluorescencyjnych podczas przygotowywania biblio-tek lub samej analizy sekwencjonowania

7. Średni czas analizy sekwencjonowania i analizy danych:
Zamawiający jest zobowiązany podać czas pracy i analizy danych dla każdego z nośników.
8. Pojemność zsekwencjonowanych zasad w jednej analizie:
Co najmniej dwie analizy dziennie do minimum 50 miliardów zasad z maksymalną liczbą odczytów w ciągu jednego dnia do minimum 260 milionów.
Tzn Konieczna możliwość zsekwencjonowania minimum 50 miliardów zasad /minimum 260 milionów odczytów w ciągu jednego dnia.

9. Możliwość analizy różnej długości fragmentów:
Możliwość pracy w różnych trybach długości odczytów (minimum 3: do 200 bp / do 400 bp / do minimum 600 bp w zależności od aplikacji i wybranego nośnika

10. Pole danych o pojemności:
Wbudowana pamięć 25 TB lub 12TB/24TB za pomocą lokalnego serwera


Dodatkowo wymagane jest aby urządzenie wyposażone było w:
 dodatkowy prekonfigurowany serwer:
wymagana minimalna konfiguracja: procesor 2x6 rdzeni (12 rdzeni obliczeniowych), 48 GB pamięci operacyjnej (RAM), minimum 12 TB przestrzeni dyskowej z możliwością rozbudo-wy do 24 TB (w konfiguracji RAID), karta graficzna, w tym oprogramowanie operacyjne (na przykład: Ubuntu lub podobne) , dostępny za pomocą interfejsu przeglądarki interneto-wej, w tym wtyczki programowe wymagane do podstawowych procedur analizy danych, w tym w pełni kompatybilne oprogramowanie z oprzyrządowaniem NGS
 zewnętrzne oprogramowanie do sekwencjonowania analizy danych
podstawowe oprogramowanie kontrolno-analityczne jest dostarczane bezpłatnie w ramach urządzenia i działa na zasadzie interfejsu "przeglądarki internetowej", producent powinien zapewnić również dostęp do określonego oprogramowania ewaluacyjnego w postaci przed-płaconych licencji oraz możliwość korzystania w chmurze (podać jakie) oraz Wykonawca za-pewnić bezpłatną aktualizację oprogramowania
Możliwość zapewnienia pracy z różnymi formatami danych (jak: FASTQ, .BAM, .vcf)
Możliwość eksportu danych do chmury - Wykonawca zapewni możliwość przechowywania danych w chmurze do minimum pojemności 100 GB za darmo z możliwością rozbudowy za dodatkową opłatą.

 Moduł do przygotowania bibliotek
W pełni automatyczna stacja preparatywna powinna być w pełni kompatybilna z technologią paneli amplikonów , która umożliwia bezobsługowe przygotowywanie bibliotek próbek z wyko-rzystaniem paneli genów do sekwencjonowania amplikonów składających się z co najmniej jed-nej puli starterów,
system powinien umożliwiać również bezobsługowe wzbogacanie i oczyszczanie bibliotek me-todą emulsyjnej reakcji PCR oraz w pełni załadowany nośnik, który można sekwencjonować na-tychmiast po załadowaniu
system powinien posiadać wbudowany blok termocyklera, wirówki reakcyjne i wirówkę do na-pełniania układów sekwencyjnych, ramię robota z czytnikiem kodów QR i lampę UV do utrzy-mania czystości w module, całkowity czas przygotowania stacji nie powinien przekraczać 45 min.
Moduł powinien umożliwiać przygotowanie co najmniej 8 próbek do sekwencjonowania w ciągu około 20 godzin. Pojemność modułu to maksymalnie co najmniej 8 próbek na jeden cykl przygo-towania biblioteki, a następnie do minimum 384 próbek do emulsyjnego PCR i ładowania nośni-ka w zależności od wybranej aplikacji i formatu nośnika

Instalacja i serwis
Montaż całego systemu i sprawdzenie poprawności działania przeprowadza autoryzowany, do-świadczony serwis producenta w placówce Zamawiającego – Załączyć dokument autoryzacji serwisu na trenie Polski
Szkolenie
Wykonawca zapewnia szkolenie dla 2-3 osób w miejscu instalacji systemu w wymiarze minimum 5 dni, przez dedykowany Dział wsparcia aplikacyjnego autoryzowany przez producenta w języ-ku polskim – z wykorzystaniem odczynników dostarczonych i finansowanych przez dostawcę/ firmę realizującą zamówienie .

Wsparcie bioinformatyczne – minimum 20 h wsparcia

Zasilacz - 230 V / 50 Hz

Gwarancja - Przedłużona do minimum 24 miesiące na wszystkie części montażu wraz z uwzględnionym przeglądem.





 Fluorometr do pomiaru stężenia DNA / RNA / białek
( z pakietem odczynników startowych)
1. Mała waga poniżej 1 kg, wymiary nie większe niż 14 cm × 30 cm × 6 cm
2. Możliwy pomiar stężenia ssDNA, dsDNA ( o stężeniu w zakresie co najmniej 10 pg/µL do 100 ng/µL), RNA (o stężeniu co najmniej w zakresie: 250 pg/µL - 100 ng/µL), białka, miR-NA, oraz dodatkowo innych związków m.in. glukozy, cholesterolu za pomocą fluorescencji
3. Dotykowy kolorowy wyświetlacz
4. Zakres dynamiczny aparatu 5 rzędów wielkości
5. Czas procesowania próbki do maksimum 5 sekund
6. Czas nagrzewania aparatu do pracy poniżej 35 sekund
7. Pamięć aparatu pozwalająca na archiwizację minimum 1000 pomiarów
8. Pomiar odbywa się w probówkach plastikowych o pojemności 500 ul
9. Pomiar odbywa się w zamykanej komorze pomiarowej
10. Port USB do eksportu plików CSV
11. Objętość próbki do pomiaru 1-20 ul
12. Aparat wyposażony w zewnętrzny moduł WiFi
13. Dostępny na stronie producenta program do tworzenia własnych protokołów gotowych do wgrania do aparatu za pomocą USB
14. Gwarancja minimum 12 miesięczna na wszystkie części montażu
15. Optyka:
Źródła światła:
• Niebieski LED (max ~470 nm)
• Czerwony LED (max ~635 nm)
Filtry wzbudzania:
• Niebieski 430–495 nm
• Czerwony 600–645 nm
Filtry emisji:
• Zielony 510–580 nm
• Czerwony 655–725 nm
Pomiar przy pomocy fotodiod 300–1000 nm


 Statyw magnetyczny na probówki 1,5-2,0mL
• Statyw magnetyczny na probówki 1,5-2,0mL - zoptymalizowany pod kątem wydajnej separa-cji magnetycznej z użyciem wszystkich typów kulek Dynabeads® lub równoważnych (zakres średnic 1-4,5 µm) w małych objętościach próbek.
Optymalna objętość robocza to minimum 10-2,000 µL.
Statyw posiada około 16 ponumerowanych miejsc (po 8 z każdej strony) na probówki o pojem-ności 1,5- 2 mL. Górną część statywu można łatwo wyjąć z podstawy magnetycznej w celu np. zworteksowania, manualnego wytrząsania próbek lub wykorzystać do przechowywania próbek.
Gwarancja minimum 12 miesięczna na wszystkie części montażu


 Statyw magnetyczny na płytki PCR/probówki PCR w paskach 8-dołkowych
Statyw magnetyczny na płytki PCR/probówki PCR w paskach 8-dołkowych przeznaczony do paramagnetycznego wytrącania kulek ze standardowych 96-dołkowych mikropłytek z dnem w kształcie litery U. Statyw powinien posiadać plastikową podstawę w standardowej 96-dołkowej płytce mikrotitracyjnej SBS.
Musi posiadać 96 indywidualnych niezwykle mocnych pierścieni magnetycznych do separacji magnetycznej. Z zastosowaniem tego statywu kulki paramagnetyczne osadzają się probówce płytki - dołku w kształcie pierścienia o średnicy ~ 6 mm, co ułatwia usuwanie supernatantu za pomocą robota lub pipety wielokanałowej.
Gwarancja minimum 12 miesięczna.

4.5.3.) Główny kod CPV: 38434540-3 - Sprzęt biomedyczny

SEKCJA V ZAKOŃCZENIE POSTĘPOWANIA

5.1.) Postępowanie zakończyło się zawarciem umowy albo unieważnieniem postępowania: Postępowanie/cześć postępowania zakończyła się zawarciem umowy

SEKCJA VI OFERTY

6.1.) Liczba otrzymanych ofert lub wniosków: 1

6.1.1.) Liczba otrzymanych ofert wariantowych: 0

6.1.2.) Liczba ofert dodatkowych: 0

6.1.3.) Liczba otrzymanych od MŚP: 1

6.1.4.) Liczba ofert wykonawców z siedzibą w państwach EOG innych niż państwo zamawiającego: 0

6.1.5.) Liczba ofert wykonawców z siedzibą w państwie spoza EOG: 0

6.1.6.) Liczba ofert odrzuconych, w tym liczba ofert zawierających rażąco niską cenę lub koszt: 0

6.1.7.) Liczba ofert zawierających rażąco niską cenę lub koszt: 0

6.2.) Cena lub koszt oferty z najniższą ceną lub kosztem: 1018504,89 PLN

6.3.) Cena lub koszt oferty z najwyższą ceną lub kosztem: 1018504,89 PLN

6.4.) Cena lub koszt oferty wykonawcy, któremu udzielono zamówienia: 1018504,89 PLN

6.5.) Do wyboru najkorzystniejszej oferty zastosowano aukcję elektroniczną: Nie

6.6.) Oferta wybranego wykonawcy jest ofertą wariantową: Nie

SEKCJA VII WYKONAWCA, KTÓREMU UDZIELONO ZAMÓWIENIA

7.1.) Czy zamówienie zostało udzielone wykonawcom wspólnie ubiegającym się o udzielenie zamówienia: Nie

7.2.) Wielkość przedsiębiorstwa wykonawcy: Mały przedsiębiorca

7.3.) Dane (firmy) wykonawcy, któremu udzielono zamówienia:

7.3.1) Nazwa (firma) wykonawcy, któremu udzielono zamówienia: Life Technologies Polska Sp. z o.o.

7.3.2) Krajowy Numer Identyfikacyjny: NIP: 118-00-39-931

7.3.3) Ulica: ul. Bonifraterska 17

7.3.4) Miejscowość: Warszawa

7.3.5) Kod pocztowy: 00-203

7.3.6.) Województwo: mazowieckie

7.3.7.) Kraj: Polska

7.4.) Czy wykonawca przewiduje powierzenie wykonania części zamówienia podwykonawcom?: Nie

SEKCJA VIII UMOWA

8.1.) Data zawarcia umowy: 2021-10-06

8.2.) Wartość umowy/umowy ramowej: 1018504,89 PLN

8.3.) Okres realizacji zamówienia albo umowy ramowej: 1 miesiące