Ogłoszenie o zmianie ogłoszenia
DOSTAWA SPECJALISTYCZNYCH ODCZYNNIKÓW CHEMICZNYCH Z ZAKRESU BIOLOGII I GENETYKI STOSOWANYCH DO NGS, GENOTYPOWANIA i PRZYGOTOWYWANIA PRÓBEK, PRODUKTOWANYCH PRZEZ FIRMĘ ILLUMINA Inc. ORAZ 10XGENOMICS

SEKCJA I - ZAMAWIAJĄCY

1.1.) Nazwa zamawiającego: INSTYTUT GENETYKI CZŁOWIEKA POLSKIEJ AKADEMII NAUK

1.3.) Krajowy Numer Identyfikacyjny: REGON 000326428

1.4.) Adres zamawiającego:

1.4.1.) Ulica: ul. Strzeszyńska 32

1.4.2.) Miejscowość: Poznań

1.4.3.) Kod pocztowy: 60-479

1.4.4.) Województwo: wielkopolskie

1.4.5.) Kraj: Polska

1.4.6.) Lokalizacja NUTS 3: PL415 - Miasto Poznań

1.4.9.) Adres poczty elektronicznej: ord-igcz@man.poznan.pl

1.4.10.) Adres strony internetowej zamawiającego: https://igcz.poznan.pl/

1.5.) Rodzaj zamawiającego: Zamawiający publiczny - inny zamawiający

Instytut naukowy Polskiej Akademii Nauk

1.6.) Przedmiot działalności zamawiającego: Inna działalność

naukowa

SEKCJA II – INFORMACJE PODSTAWOWE

2.1.) Numer ogłoszenia: 2022/BZP 00183141

2.2.) Data ogłoszenia: 2022-05-27

SEKCJA III ZMIANA OGŁOSZENIA

3.1.) Nazwa zmienianego ogłoszenia:

Ogłoszenie o zamiarze zawarcia umowy

3.2.) Numer zmienianego ogłoszenia w BZP: 2022/BZP 00121676/01

3.3.) Identyfikator ostatniej wersji zmienianego ogłoszenia: 01

3.4.) Identyfikator sekcji zmienianego ogłoszenia:

SEKCJA II – INFORMACJE PODSTAWOWE

3.4.1.) Opis zmiany, w tym tekst, który należy dodać lub zmienić:

2.1. Nazwa zamówienia

Przed zmianą:
DOSTAWA SPECJALISTYCZNYCH ODCZYNNIKÓW CHEMICZNYCH Z ZAKRESU BIOLOGII I GENETYKI STOSOWANYCH DO NGS, GENOTYPOWANIA i PRZYGOTOWYWANIA PRÓBEK, PRODUKTOWANYCH PRZEZ FIRMĘ ILLUMINA Inc.

Po zmianie:
DOSTAWA SPECJALISTYCZNYCH ODCZYNNIKÓW CHEMICZNYCH Z ZAKRESU BIOLOGII I GENETYKI STOSOWANYCH DO NGS, GENOTYPOWANIA i PRZYGOTOWYWANIA PRÓBEK, PRODUKTOWANYCH PRZEZ FIRMY ILLUMINA Inc. ORAZ 10XGENOMICS

3.4.) Identyfikator sekcji zmienianego ogłoszenia:

SEKCJA III – PRZEDMIOT ZAMÓWIENIA

3.4.1.) Opis zmiany, w tym tekst, który należy dodać lub zmienić:

3.2. Numer referencyjny

Przed zmianą:
2/WR/2022 specjalistyczne odczynniki ILLUMINA

Po zmianie:
2/WR/2022 specjalistyczne odczynniki ILLUMINA, 10XGENOMICS

3.4.1.) Opis zmiany, w tym tekst, który należy dodać lub zmienić:

3.5. Wartość zamówienia

Przed zmianą:
130000

Po zmianie:
490000,00

3.4.) Identyfikator sekcji zmienianego ogłoszenia:

SEKCJA IV - TRYB UDZIELENIA ZAMÓWIENIA

3.4.1.) Opis zmiany, w tym tekst, który należy dodać lub zmienić:

4.2. Uzasadnienie faktyczne i prawne wyboru trybu negocjacji bez ogłoszenia albo zamówienia z wolnej ręki

Przed zmianą:
U. p: dostawa specjalistycznych odczynników chemicznych z zakresu biologii i genetyki produkowanych przez illumina Inc może być świadczona tylko przez jednego Wykonawcę z przyczyn technicznych o obiektywnym charakterze. Zamawiający zamierza udzielić zamówienia Wykonawcy, który ma wyłączne prawo do dystrybucji odczynników.
U. f: odczynniki chemiczne w Instytucie stosuje się zgodnie z działalnością statutową w celach prowadzonych badań naukowych w zakresie nauk medycznych i biologicznych. Wyniki badań są wykorzystywane w publikacjach, służąc również innym placówkom krajowym i zagranicznym. Sprzedawane przez ANALITYK jedynego dystrybutora Illumina. Innowacyjne technologie sekwencjonowania Illumina Inc napędzają przełomowe postępy w badaniach naukowych, genomice translacyjnej i konsumenckiej oraz diagnostyce molekularnej. Instytut posiada platformę sekwencjonowania NGS illumina Inc NextSeq 2000 oraz MiniSeq, które do pracy wymagają wyłącznie odczynników dedykowanych producenta sprzętu.

Po zmianie:
U. p: dostawa specjalistycznych odczynników chemicznych z zakresu biologii i genetyki produkowanych przez Illumina Inc oraz 10xGenomics, może być świadczona tylko przez jednego Wykonawcę z przyczyn technicznych o obiektywnym charakterze. Zamawiający zamierza udzielić zamówienia Wykonawcy, który ma wyłączne prawo do dystrybucji odczynników.
U. f: odczynniki w Instytucie stosuje się zgodnie z działalnością statutową w celach prowadzonych badań naukowych w zakresie nauk medycznych i biologicznych. Wyniki badań są wykorzystywane w publikacjach, służąc również innym placówkom krajowym i zagranicznym. Innowacyjne technologie sekwencjonowania Illumina napędzają przełomowe postępy w badaniach naukowych, genomice translacyjnej i konsumenckiej oraz diagnostyce molekularnej. Instytut posiada platformę sekwencjonowania NGS illumina Inc NextSeq 2000 oraz MiniSeq, które do pracy wymagają wyłącznie odczynników dedykowanych producenta sprzętu.

3.4.) Identyfikator sekcji zmienianego ogłoszenia:

SEKCJA VI - INFORMACJE DODATKOWE

3.4.1.) Opis zmiany, w tym tekst, który należy dodać lub zmienić:

6.1. Informacje dodatkowe

Przed zmianą:

Po zmianie:
Uzasadnienie faktyczne dla 10xGenomics:
Technologie proponowane przez firmę 10xGenomics znajdują zastosowanie w obszarze sekwencjonowania pojedynczej komórki, przestrzennej transkryptomiki oraz technik in situ.
Technologia Chromium Single Cell-Sekwencjonowanie pojedynczej komórki.
10x Genomics udostępnia technologię pozwalającą na sekwencjonowanie pojedynczej komórki dzięki wykorzystaniu innowacyjnego podejścia Next GEM zintegrowanego z platformami Chromium. Podstawą technologii Next GEM są żelowe kulki, z których każda pokryta jest unikalnymi sekwencjami oligonukleotydowymi oraz sekwencjami funkcjonalnymi pozwalającymi na analizę aktywności komórek w wielu wymiarach w zależności od specyfiki przeprowadzanej procedury. Wśród oferowanych możliwości, badanie na poziomie pojedynczej komórki może przebiegać pod kątem ekspresji genów, dostępności chromatyny, identyfikacji białek powierzchniowych, edycji CRISPR oraz innych. Wykorzystanie zjawiska procesów mikroprzepływowych (mikrofluidyka) które zachodzą na urządzeniach Chromium w połączeniu z dedykowanymi chipami daje możliwość generowania dziesiątek tysięcy partycji w skład których wchodzą pojedyncze komórki lub jądra, żelowe kulki z indywidualnymi sekwencjami różnicującymi oraz odczynniki potrzebne do wytworzenia mikroreakcji. Na końcowym etapie, wszystkie fragmenty pochodzącej z tej samej komórki lub jądra będą miały wspólną sekwencję różnicującą (10x Barcode) i posłużą jako materiał wejściowy do przygotowania bibliotek NGS kompatybilnych miedzy innymi z sekwenatorami Illumina dostępnymi w Instytucie Genetyki Człowieka PAN.
Technologia Visium Spatial- Transkryptomika przestrzenna.
Związek pomiędzy komórkami i ich względną lokalizacją w tkance ma kluczowe znaczenia dla zrozumienia prawidłowego rozwoju i patologii chorób. Transkryptomika przestrzenna to przełomowa metoda profilowania molekularnego, która pozwala ocenić aktywność genów w próbce i mapować, gdzie ta aktywność występuje. Technologia Visium Spatial wykorzystuje procesy wychwytywania przestrzennego dzięki zastosowaniu oligonukelotydów których rolą jest wiązanie mRNA oraz znakowanie cząsteczek przy udziale dedykowanych sekwencji. Oligonukleotydy rozmieszczone są na szkiełku w celu zachowania informacji przestrzennych. W efekcie, wyznakowane cząsteczki, mapowane są do określonego miejsca na obszarze wychwytywania na szkiełku a dane dotyczące ekspresji nakładane na wysokiej rozdzielczości obraz mikroskopowy. Zawarcie umowy z wyłącznym dystrybutorem Analityk gwarantuje ciągłość dostaw przez cały okres prowadzonych badań, prawidłowość i powtarzalność wyników oraz wysoką jakość wykonywanych badań, licznie opisywanych w krajowych i międzynarodowych publikacjach naukowych.